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Los caballos Frisones son conocidos por su distintivo pelaje negro, pero aunque se ha asumido durante mucho tiempo que este es el único color existente en la raza, no es del todo cierto. A lo largo de la historia de la raza, ha habido casos de Frisones con pelajes rojos o colorados. Esto se debe a que en sus orígenes, la raza se formó mediante la cruza de diversas razas antiguas que incluían caballos de diferentes colores.
Para lograr unificar el pelaje de los Frisones en un solo color, los criadores se propusieron seleccionar y cruzar específicamente con el objetivo de obtener ejemplares de pelaje negro. Sin embargo, existen algunos criadores que aprovechan la falta de conocimiento de las personas para promocionar los Frisones de pelaje rojo o colorado como ejemplares raros y exóticos, incluso afirmado que son más valiosos que los de pelaje negro. Esto se basa en la escasez de ejemplares de estos colores en el mundo, pero en realidad no son tan exóticos ya que son resultado de errores en la selección de la raza y no son aceptados en todas las asociaciones de Frisones.
Los verdaderos criadores apasionados por la raza hacen todo lo posible para evitar los caballos de pelajes diferentes, ya que se consideran un retroceso en la selección. Incluso si naciera un caballo de estos colores en sus criaderos, no lo registrarían en las asociaciones y lo considerarían no apto para la reproducción. Es importante mencionar que los Frisones con pelaje rojo o colorado no son el resultado de enfermedades o impurezas genéticas, sino que son producto de la diversidad natural de la genética.
La CCA-FPS, la asociación más famosa de caballos Frisones, ha estado constantemente en contra de la diversidad de la naturaleza, ya que no es normal que una raza de caballos esté compuesta únicamente por un solo pelaje. A pesar de años de estudios y selecciones, aún no han logrado superar la diversidad natural en la raza. Actualmente se ha estudiado un gen para determinar el color en los Frisones, que se divide en dominante y recesivo.
Un caballo Frisón será de color negro si presenta un gen dominante, sin importar si lo heredó del padre o la madre. En cambio, si hereda dos genes recesivos, será de color rojo o colorado. Los caballos que presentan los dos genes dominantes siempre tendrán crías de color negro, sin importar con qué ejemplares se crucen.
Existen casos famosos de Frisones colorados, como el semental Real, que tuvo más de 300 hijos, todos con pelaje rojo. A través de su madre, se pudo rastrear el gen colorado hasta llegar al presidente 123, quien tuvo un potro colorado en 1920. Sin embargo, no todas las crías de Frisones colorados heredarán su color.
Es posible que dentro de la raza Frisona haya más colores que aún no se han manifestado debido a la falta de combinación genética adecuada. Si la situación de los Frisones colorados escapa de las manos de las asociaciones, es probable que aparezcan nuevos colores ocultos en los genes de la raza.
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